Le Recteur est la plus haute autorité de l’Université Antonine (UA). Élu par le Conseil général de l’Ordre antonin maronite (OAM), le Recteur exerce ses fonctions pour un mandat renouvelable de 6 ans. Porte-parole désigné de l’OAM et du Conseil des fiduciaires au sein de l’Université, il représente celle-ci dans ses relations extérieures. En tant que président du Rectorat, il est assisté dans l’exercice de ses fonctions par le Conseil administratif, dont les membres exercent leur autorité de représentation dans leurs domaines de compétence respectifs.
Dans le cadre de sa mission, le Recteur a pour devoir de veiller à ce que l’établissement fonctionne selon les principes de collégialité et de transparence, du leadership stratégique, qu’il offre un système d’éducation centré sur l’étudiant, tout en maintenant sa solide réputation. Le Recteur préside les réunions des conseils et des comités, au cours desquelles sont décidées les mesures communes et stratégiques.